از سوی دیگر مرتضی آقاخان بار دیگر آسیب دید و فصل را از دست داد. ماشینسازی و ذوبآهن هم درصدد هستند تا در صورت عدم وصول مطالباتشان تبریزی و شجاعیان را محروم کنند تا نگرانیهای شفر به اوج برسد. در جریان دیدار تیمهای عراق و قطر در جام ملتهای آسیا، طارق همام هافبک میانی و جنگنده آبیها که در ترکیب این تیم جا افتاده بود، نیز دچار آسیبدیدگی جدی شد و در همان نیمه نخست میدان را ترک کرد. اگرچه از میزان و شدت آسیبدیدگی این هافبک عراقی اطلاع دقیقی در دست نیست، اما احتمال اینکه وی هفتههای نخست نیمفصل دوم را از دست بدهد، وجود دارد. همام عراقی اما تنها مصدوم استقلال در تعطیلات نیمفصل نیست و تعداد مراجعهکنندگان به کلینیک دکتر نوروزی، به شکل عجیبی افزایش پیدا کرده است. بعد از اینکه استقلالیها نیم فصل را با پایان مصدومیت سهرابیان و اسماعیلی و همچنین بازگشت شجاعیان، آقاخان و محسن کریمی آغاز کردند، امیدواری زیادی برای ادامه فصل داشتند اما حالا دوباره شاهد پرتعداد شدن مصدومان تیم هستیم. مرتضی آقاخان به شکل عجیبی با مصدومیت از ناحیه آشیل روبهرو شد و در جریان اردوی ترکیه نتوانست آبیها را همراهی کند تا فصل را بهطور کامل از دست بدهد. استقلالیها روی آقاخان در خط حمله حساب کرده بودند اما شرایط به شکل غیرقابل انتظاری برای شفر بد شده است. روحا... باقری دیگر مهاجم استقلال نیز به دلیل مصدومیت به اردوی ترکیه نرفت و تمرینات مهم بدنسازی را از دست داد و احتمالا به زودی به تمرینات اضافه میشود اما زمان زیادی برای آمادهسازی نیاز دارد. دیگر مصدوم استقلال، مهره کلیدی این تیم یعنی علی کریمی است. کریمی به دلیل مصدومیت جام ملتها را از دست داد و سپس به ترکیه رفت اما در ترکیه نیز خبری از حضور او در ترکیب استقلال نبود و در تمرینات نیز حاضر نشد تا به اینترتیب شرایط برای او نیز مناسب نباشد و آبیها یک مهره دیگر را از دست بدهند. به این لیست باید میلاد زکیپور را نیز اضافه کرد که شایعاتی درباره مصدومیت او به گوش میرسد و در آخرین دیدار دوستانه استقلال نیز به میدان نرفت. همچنین سجاد آقایی مهاجم جوان استقلالیها نیز هنوز به تمرینات بازنگشته و وضعیت او برای ادامه مسابقات مشخص نیست. وینفرد شفر امیدوار است تا شروع لیگ لیست محدود او، محدودتر از گذشته نشود و تیم ملی و تمرینات آمادهسازی نیم فصل دوم باعث مصدومیت دوباره بازیکنان استقلال نشود؛ اتفاقی که میتواند شروع نیم فصل دوم را از آن چیزی که انتظار میرود، سختتر کند.